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Industry Impact
Exosome Research Direction
We're facing the
challenges
of life head on.
Cell:大規(guī)模蛋白質組學揭示多種癌癥細胞外囊泡標志物,助力癌癥液體活檢

 

   近日,康奈爾大學Weill Cornell Medicine科學家/外泌體與腫瘤領域大牛David Lyden和紀念斯隆-凱特琳癌癥中心William R. Jarnagin教授等團隊合作在Cell雜志上發(fā)表文章,該研究對來自426個人源樣品的細胞外囊泡和顆粒(EVP)的全面蛋白質組學分析,確定了泛EVP標志性蛋白,用于EVP分離的生物標記;和特異性EVP標志性蛋白,用于癌癥檢測和確定癌癥類型。

    

   (這Author list…夠長…)

   病理學家通常使用組織活檢來診斷癌癥、癌癥擴散并監(jiān)測治療反應。液體活檢具有最小的侵入性,可以連續(xù)獲得,并且可以在更早、更可治愈的階段檢測到癌癥。隨著對液體活檢技術用于早期癌癥檢測的期望的增長,外泌體可能會提供寶貴的資源。

   外泌體是內體來源的30-150 nm納米囊泡,富含核酸、脂質和蛋白質,可在正常的生理和病理學中介導細胞間的通訊。以前的研究報道了腫瘤來源的外泌體蛋白在腫瘤進展、免疫調節(jié)和轉移中的預后和功能重要性。此外,該團隊還闡明過細胞外納米顆粒的異質性,定義了三個不同的亞群,即小外泌體(Exo-S)、大外泌體(Exo-L)和外泌顆粒(exomeres),統(tǒng)稱為細胞外囊泡和顆粒(EVP)(相關報道:https://www.exosomemed.com/4061.html)。

   越來越多的證據(jù)表明,EVP可用于早期癌癥檢測、預后和指導治療。EVP以大于109囊泡/mL的濃度活躍地釋放在周圍循環(huán)中,為下游分析提供了充足的材料?;谫|譜的蛋白質組分析已成為一種策略,可深入了解循環(huán)EVP的生物學和臨床潛力。

   盡管有幾種EVP蛋白質數(shù)據(jù)庫(例如Vesiclepedia、EVpedia、ExoCarta)公開可用,但關于EVP蛋白質組的知識仍然很大程度上未知,包括:

   (1)用于可靠分離人EVP的標記物,不管是什么組織來源的;

   (2)區(qū)分癌癥與非癌癥的標志物;

   (3)特定原發(fā)腫瘤(例如,肺、胰腺、乳腺等)特有的標志物。

   為了解決這一知識差距,該研究試圖定義EVP蛋白特征,以區(qū)分癌癥患者與健康個體。

    

   為了鑒定通用的EVP標記并改善人類EVP的分離方法,該研究通過蛋白質組分析對497個樣品進行了分析。在傳統(tǒng)的外泌體標記中,熱休克相關的71 kDa蛋白(HSPA8)、熱休克蛋白HSP 90-beta(HSP90AB1)、CD9和程序性細胞死亡6相互作用蛋白(ALIX)是從細胞、組織和大多數(shù)生物流體中分離出來人EVP中最突出的標記。該研究確定了>50%的人源樣品共享的13種其他蛋白質,從而極大地擴展了人類EVP標志性蛋白的范圍。

    

   從7個不同來源的497個樣品中獲得的EVP的蛋白質組學表征

 

   各種癌癥患者血漿中與腫瘤相關的EVP標志性蛋白的鑒定

   通過對比分析胰腺癌和肺癌患者可行手術標本中配對的腫瘤和鄰近組織的EVP蛋白質組,研究確定了癌癥特異性EVP蛋白特征。此外,通過比較匹配的組織外植體(TE)和血漿衍生的EVP,發(fā)現(xiàn)了癌癥患者血漿中獨特的腫瘤相關EVP蛋白,并確定EVP血漿蛋白來源于腫瘤微環(huán)境、遠處器官和免疫系統(tǒng)。接下來,分析了幾種兒童和成人癌癥的I-IV期癌癥的組織和血漿EVP蛋白質組,并將它們與非腫瘤組織和健康對照(HC)血漿進行了比較。EVP蛋白質組的隨機森林分類顯示,癌癥檢測的特異性和敏感性分別為90%和94%(組織),95%和90%(血漿)。重要的是,血漿衍生的EVP組分可以區(qū)分患者的癌癥類型。這些數(shù)據(jù)表明,腫瘤相關的EVP蛋白可以作為早期癌癥檢測的生物標志物,并對不確定的原發(fā)腫瘤類型進行分類。

    

   腫瘤衍生的EVP標志性蛋白對原發(fā)性腫瘤進行分類

 

   圖解摘要

   總之,該報道探究了來自組織外植體(TEs)、血漿和其它體液的426個人類樣品中細胞外囊泡和顆粒(EVP)的蛋白質組學特征。在傳統(tǒng)的外泌體標志性蛋白中,CD9、HSPA8、ALIX和HSP90AB1代表pan-EVP標記,而ACTB、MSN和RAP1B是新穎的pan-EVP標記。為了確認EVP是理想的診斷工具,該研究分析了TE-(n=151)和血漿來源(n=120)EVP的蛋白質組。TE EVP的比較鑒定出以90%的敏感性/94%的特異性將腫瘤與正常組織區(qū)分開的蛋白質(例如VCAN、TNC和THBS2)。血漿來源的EVP組分(包括免疫球蛋白)的機器學習分類顯示,在檢測癌癥時靈敏度為95%/特異性為90%。最后,在TEs和血漿中定義了一組腫瘤類型特異性EVP蛋白,可以對未知原發(fā)性腫瘤進行分類。因此,EVP蛋白可以用作癌癥檢測和確定癌癥類型的可靠生物標記。

   要點:

   426個人源樣品的細胞外囊泡和顆粒(EVP)的蛋白質組學概況泛EVP標志性蛋白的鑒定人體組織和血漿中腫瘤來源的EVP標志性蛋白的表征EVP蛋白可用于癌癥檢測和確定癌癥類型

 

   DavidLyden外泌體研究相關文章報道:

   1.     Nat Cell Biol | 康奈爾大學科學家David Lyden揭示外泌體的不同亞群并發(fā)現(xiàn)一種新的更小的外泌顆粒https://www.exosomemed.com/4061.html2.     NCB:腫瘤外泌體CEMIP蛋白促進腦轉移中的癌細胞定植https://www.exosomemed.com/6437.html3.     Nature:外泌體整合素分子決定了腫瘤轉移的器官傾向性https://www.exosomemed.com/114.html4.     Nature cell biology:胰腺癌外泌體起始肝臟中轉移前微環(huán)境的形成https://www.exosomemed.com/96.html

 

   參考文獻:

   ExtracellularVesicle and Particle Biomarkers Define Multiple Human Cancers. CellDOI: 10.1016/j.cell.2020.07.009

 

 

https://www.exosomemed.com/7565.html

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